Seminarium: mgr inż. Julia Merta
20 maja podczas seminarium katedry mgr inż. Julia Merta zaprezentowała narzędzie HistoKit, przeznaczone do przetwarzania obrazów całych preparatów mikroskopowych (WSI). Oprogramowanie umożliwia detekcję obszaru tkanki oraz artefaktów z wykorzystaniem modelu uczenia głębokiego GrandQC, a także normalizację barwienia i podział obrazów na mniejsze fragmenty w celu przygotowania danych do treningu modeli uczenia głębokiego.
W trakcie wystąpienia przedstawiono również porównanie skuteczności oryginalnej wersji algorytmu GrandQC, narzędzia HistoQC oraz HistoKit w zakresie detekcji artefaktów. Analizę przeprowadzono m. in. na samodzielnie oznaczonym zbiorze danych obejmującym obrazy histopatologiczne pochodzące z otwartych baz TCGA oraz obrazy z projektu Compass NMD.
