Laboratorium Analizy Danych
Kierownik laboratorium:
Prof. dr hab. inż. Joanna Polańska,

Laboratorium Analizy Danych

Kierownik laboratorium:
Prof. dr hab. inż. Joanna Polańska,

      Prace prowadzone w grupie kierowanej przez dr hab. inż. Joannę Polańską dotyczą zastosowań technik analizy eksploracyjnej danych, statystyki oraz metod modelowania matematycznego w zagadnieniach z zakresu biologii i medycyny, a przede wszystkim w problemach analizy danych pozyskiwanych z wykorzystaniem technik wysokoprzepustowych biologii molekularnej, w tym genetyki, genomiki, transkryptomiki, proteomiki oraz metabolomiki. W obszarze zainteresowań członków grupy leżą problemy związane z algorytmami identyfikacji poziomu szumów oraz technikami filtracji oraz ekstrakcji cech stosowanymi w analizie danych mikromacierzowych, widm proteomicznych i lipidomicznych, oraz w spektroskopii i obrazowaniu magnetycznego rezonansu jądrowego, a w szczególności tych wykorzystujących metody dekompozycji dystrybucji sygnałów jako mieszaniny rozkładów normalnych. Prowadzone są badania nad zagadnieniami selekcji cech oraz optymalizacji liniowych i nieliniowych klasyfikatorów, doboru metryk oraz algorytmów agregacji w procesie grupowania i bigrupowania, oraz metod integracji danych o wspólnym kontekście biologicznym. Członkowie grupy zaangażowani są również w konstrukcję narzędzi bioinformatycznych pozwalających na reannotację wysokoprzepustowych platform pomiarowych (mikromacierze cDNA i DNA, macierze promotorowe ChIP-on-chip, macierze genomowe oraz SNPowe) oraz identyfikację i korektę artefaktów pojawiających się w trakcie procesu pomiarowego. Istotnym elementem prac są badania nad opracowaniem metod analizy statystycznej oraz walidacji wyników w badaniach o niewielkiej liczności grup badawczych oraz niestandardowych planach eksperymentu.
Równolegle prowadzone są badania związane z konstrukcją wielowymiarowych modeli epidemiologicznych zachorowań na choroby autoimmunologiczne, a w szczególności na cukrzycę typu 1 oraz chorobę Gravesa-Basedowa. Metody modelowania matematycznego wykorzystywane są również do konstrukcji modeli sezonowości wyrównania metabolicznego wśród dzieci chorujących na cukrzycę typu 1 wybranych regionów Polski.
Członkowie zespołu współpracują z centrami badawczymi oraz ośrodkami medycznymi w Polsce, Wielkiej Brytanii, Szwecji, Niemczech, Francji oraz Belgii. Efekty badań publikowane są w prestiżowych czasopismach naukowych oraz referowane na międzynarodowych i krajowych konferencjach.

Pozostali pracownicy i doktoranci laboratorium:

Samodzielni pracownicy naukowi:
Dr hab. inż. Artur Cieślar-Pobuda, Współpracownik

Adiunkci:
Dr inż. Franciszek Binczyk
Dr inż. Łukasz Król
Dr inż. Michał Marczyk
Dr inż. Anna Papież
Dr inż. Aleksandra Pfeifer
Dr inż. Joanna Żyła

Doktoranci:
Mgr inż. Agnieszka Cecotka
Mgr inż. Grzegorz Drążek
Mgr inż. Katarzyna Frątczak
Mgr inż. Anna Glodek
Mgr Mateusz Kania
Mgr inż. Szymon Kocot
Mgr inż. Kinga Leszczorz
Mgr Anna Marcisz
Mgr inż. Justyna Mika
Mgr inż. Grzegorz Mrukwa
Mgr inż. Wojciech Prażuch
Mgr inż. Bożena Rolnik
Mgr inż. Katarzyna Sieradzka
Mgr inż. Aleksandra Suwalska
Mgr inż. Joanna Tobiasz

Laboratorium Niewerbalnej Komunikacji Interpersonalnej
Kierownik laboratorium:
Prof. dr hab. Bogdan Smołka,

Kierownik laboratorium:
Prof. dr hab. Bogdan Smołka,

      Tematyka prac badawczych prowadzonych w grupie kierowanej przez dr hab. Bogdana Smołkę koncentruje się głównie na zagadnieniach związanych z analizą wizyjną niewerbalnej komunikacji interpersonalnej. W laboratorium wyposażonym w wydajne stacje komputerowe, najnowocześniejsze kamery przeznaczone do rejestracji zjawisk krótkotrwałych oraz urządzenia umożliwiające analizę sceny trójwymiarowej, prowadzone są nowatorskie w skali światowej badania nad gestami, będącymi indykatorami ukrywanych stanów emocjonalnych, generowanych przez bodźce stresogenne. W centrum zainteresowań badawczych znajduje się szczególnie analiza dynamiki mrugnięć oraz krótkotrwałych, nieświadomych i niekontrolowanych mikroekspresji mimicznych, odzwierciedlających nasilenie emocji doznawanych przez człowieka. Celem zespołu jest opracowanie systemu wizyjnego, który poprzez analizę dynamiki punktów charakterystycznymi twarzy, a także zaawansowane modele ekstrakcji i klasyfikacji ekspresji mimicznych, umożliwi automatyczne rozpoznanie stanu psychofizycznego monitorowanych osób.
Grupa badawcza, w ramach współpracy z norweskim centrum medycznym w Forde, zajmuje się także analizą obrazów ultrasonograficznych ujawniających zmiany reumatoidalne w tkankach stawowych dłoni. Badania naukowe obejmują komputerową ocenę progresji zmian patologicznych oraz ich wizualizację. Zespół aktywnie zajmuje się także metodami poprawy jakości wizyjnej, a szczególnie redukcją szumów w obrazach cyfrowych i sekwencjach wideo. Między innymi, prowadzone są prace nad poprawą jakości obrazów astronomicznych przesyłanych przez pierwsze polskie satelity Lem i Heweliusz.
Efektem prowadzonych badań są także szybkie algorytmy koloryzacji obrazów, pozwalające na zwiększenie atrakcyjności percepcyjnej informacji kodowanej w poziomach szarości. Algorytmy koloryzacji pozwalają na rekonstrukcję barwną historycznych fotografii, filmów archiwalnych, czy też wizualizację monochromatycznych obrazów biomedycznych. Grupa badawcza zajmuje się także wyszukiwaniem informacji multimedialnych w rozległych bazach internetowych oraz ekstrakcją cech umożliwiających ich efektywną indeksację.
Członkowie zespołu współpracują z ośrodkami naukowymi w Niemczech, Norwegii, USA Kanadzie i Japonii. Efekty prac badawczych prezentowane są w monografiach i czasopismach naukowych oraz referowane na międzynarodowych, prestiżowych konferencjach.

Pozostali pracownicy i doktoranci laboratorium:

Samodzielni pracownicy naukowi:
Dr hab. inż. Adam Popowicz, Współpracownik
Dr hab. inż. Marek Szczepański,

Adiunkci:
Dr inż. Krystian Radlak

Laboratorium Obrazowania i Pomiarów Radiometrycznych,
Kierownik laboratorium:
Dr hab. inż. Henryk Palus, prof. nzw. w Pol.Śl.

Kierownik laboratorium:
Dr hab. inż. Henryk Palus, prof. nzw. w Pol.Śl.

      Prace prowadzone w grupie kierowanej przez dr hab. inż. Henryka Palusa dotyczą metod pozyskiwania i niskopoziomowego przetwarzania obrazów monochromatycznych, barwnych i wielo- i hiperspektralnych. Obszar zainteresowań członków grupy obejmuje takie problemy związane z obrazowaniem jak dobór układów oświetleniowych do systemów wizyjnych, kalibracja kolorymetryczna urządzeń pozyskiwania obrazów, korekcja winietowania obiektywów, demozaikowanie, pomiary radiometryczne charakterystyk kamer i aparatów cyfrowych itp. Realizacja takich zadań odbywa się z wykorzystaniem sprzętu oświetleniowego, wizyjnego oraz pomiarowego zgromadzonego w laboratorium w warunkach ciemni fotograficznej. Laboratorium dysponuje także licznymi wzornikami szarości i barw.
Równolegle prowadzone są prace w zakresie niskopoziomowego przetwarzania obrazów, które w szczególności obejmują techniki kwantyzacji barw (KHM), metody pikselowej i obszarowej segmentacji obrazu, detekcję obiektów w obrazie oraz wskaźniki jakości obrazu po segmentacji. Pracownicy laboratorium współdziałają z Centrum Biotechnologii Politechniki Śląskiej w zakresie obrazowania mikroskopowego i jego automatyzacji.
Członkowie zespołu współpracują także z ośrodkami naukowymi w Niemczech i Norwegii. Efekty prac badawczych prezentowane są w monografiach i czasopismach naukowych oraz referowane na międzynarodowych, prestiżowych konferencjach.

Pozostali pracownicy i doktoranci laboratorium:

Adiunkci:
Dr inż. Artur Bal
Dr inż. Mariusz Frąckiewicz

Doktoranci:
Mgr inż. Bartosz Binias
Mgr inż. Monika Mendrela
Mgr inż. Luca Miglietta
Mgr inż. Szymon Ziemek

The Spectre
CEO:
Mgr inż. Daniel Babiak

Our Mission

We want to provide you free, easy-to-use tool, that can be used for comprehensive analysis of Mass Spectrometry Imaging. We believe it will be useful during your research, and hopefully, some day also for diagnostic purposes.

What do we do?

Our team develops open source software for analysis of Mass Spectrometry Imaging data. We are part of Data Mining Group from the Silesian University of Technology, and cooperate with Maria Skłodowska-Curie Memorial Cancer Center and Institute of Oncology Gliwice Branch. This way we adapt to the needs of researchers and medical doctors.
We exhibit unique algorithms like Divisive intelligent K-means (DiviK) for compression and heterogeneity analysis, and Gaussian Mixture Model based spectra modelling or peak picking, which had been invented in Data Mining group.

Who are we?

We are a cross-university student initiative made of individuals who want to do more and break the limits. Our team consist of nine members at the moment, from Silesian University of Technology in Gliwice and University of Science and Technology in Krakow under supervision of prof. Joanna Polanska.