Do najcenniejszych kolekcji muzealnych należą:
| – | minerały skały i rudy kolekcji ks. L. Szersznika | |
| – | okazy paleozoologiczne z Solnhofen w Bawarii, Bundenbach (Palatynat Reński), Voslau i Baden w Austrii, basenu Paryża, Starych Gliwic | |
| – | minerały, skały, kopaliny i skamieniałości Górnego Śląska | |
| – | okazy rud metali, pochodzące z najważniejszych złóż świata, m. in. | |
| – | rtęci Almaden w Hiszpanii, Nikitowka (Ukraina) | |
| – | cyny Oruro w Boliwii | |
| – | wolframu Jiangxi w Chinach | |
| – | ołowiu i srebra Freiberg w Saksonii | |
| – | ołowiu Boken Hill w Australii | |
| – | cynku i ołowiu Tsumeb w Namibii | |
| – | pirytu Rio Tinto w Hiszpanii | |
| – | manganu Cziaturi w Gruzji | |
| – | żelaza Krzywy Róg na Ukrainie, Erzberg w Austrii i Kiruna i Gällivare w Szwecji | |
| – | okazy flory karbońskiej | |
| – | kolekcja chabarowska (minerały Dalekiego Wschodu – Rosja) | |
| – | okazy meteorytów żelaznych z Ameryki Północnej (ze słynnym meteorytem Canion Diablo), Afryki Południowej, Syberii i Polski (Pułtusk). | |
Ze względu na rolę w kulturze materialnej człowieka na uwag zasługuje kolekcja narzędzi krzemiennych, znajdowanych w zamieszkałych przez człowieka pierwotnego grotach – od najstarszych – pięściaków (epoka kamienia łupanego) do ostrzy i rylców (epoka kamienia gładzonego).
Godna obejrzenia, z uwagi na swoiste piękno: sposób wykształcenia, barwę, przeźroczystość, połysk i blask jest kolekcja druz kryształów: kwarcu, ametystu, fluorytu, gipsu, kalcytu, soli oraz kamieni półszlachetnych i dekoracyjnych: agatów (w tym słynne okazy z Brazylii), jaspisów, obsydianu, malachitu, azurytu i innych.
