Politechnika Śląska | Monika Kurpas

Adiunkt - Katedra Inżynierii i Biologii Systemów

Dane kontaktowe

e-mail: Monika.Kurpas@polsl.pl
Gliwice, ul. Akademicka 16
telefon: 32 2372198
pokój: 627
Plan zajęć
Publikacje

Działalność naukowa:

Biografia:

2012 – inżynier – kierunek: Biotechnologia, specjalność: Bioinformatyka, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki Politechniki Śląskiej
2013 – magister – kierunek: Biotechnologia, specjalność: Bioinformatyka, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki Politechniki Śląskiej
2019 – doktor nauk technicznych – dyscyplina: Biocybernetyka i Inżynieria Biomedyczna, specjalność: Biologia Systemów, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki Politechniki Śląskiej, wyróżnienie Rady Wydziału

od 2019 – adiunkt w Katedrze Inżynierii i Biologii Systemów, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki Politechniki Śląskiej

Badania:

modelowanie szlaków sygnałowych detekcji uszkodzeń i naprawy DNA oraz cyklu komórkowego; analiza symulacyjna i wrażliwościowa
budowanie i analiza stochastycznych modeli ewolucji klonalnej guzów nowotworowych; badanie dynamiki mutacji typu driver i passenger oraz wzorców selekcji i dryfu genetycznego na podstawie danych genomicznych
analiza filogenetyczna i bioinformatyczna genomów koronawirusa SARS-CoV-2 oraz blisko z nim spokrewnionych genomów koronawirusów nietoperzy; zastosowanie metod genetyki populacyjnej w badaniu ewolucji wariantów koronawirusa SARS-CoV-2

Dydaktyka:

Prowadzenie zajęć:

laboratoria z przedmiotów: Biologia Molekularna i Genetyka Ogólna, Biologia Komórki i Inżynieria Genetyczna, Genomika Funkcjonalna i Proteomika, Transdukcja Sygnałów i Regulacja w Układach Biologicznych, Modelowanie i Regulacja Procesów Wewnątrzkomórkowych, Sztuczna Inteligencja i Sieci Neuronowe, Biologia Systemów, Population Genetics (na kierunku Biotechnologia), Sieci Neuronowe (na kierunku Automatyka i Robotyka) oraz Bioinformatyka (na kierunku Biotechnologia, Wydział Inżynierii Środowiska i Energetyki).
ćwiczenia z przedmiotów: Biologia Systemów

Projekty:

Udział w grantach Narodowego Centrum Nauki:

2013-2014 – wykonawca w grancie N N518 287540 (Analiza biologiczna i symulacyjna ścieżki sygnałowej ATM jako aktywatora modułów p53 i NF-kB, kierownik: dr hab. inż. Krzysztof Puszyński Prof. Pol. Śl.)
2017-2019 – stypendysta doktorant w grancie OPUS DEC-2016/21/B/ST7/02241 (Modelowanie, analiza i predykcja wyników antynowotworowych terapii skojarzonych z wykorzystaniem narzędzi inżynierii systemów, kierownik: Prof. dr hab. inż. Andrzej Świerniak)
2019-2020 - post-doc w grancie OPUS UMO-2018/29/B/ST7/02550 (Podejście systemowe do progresji i prognozy raka: Nowe modele i statystyki do analizy danych genomicznych, kierownik: Prof. dr hab. inż. Marek Kimmel)
od 2022 – wykonawca w grancie OPUS UMO-2021/41/B/NZ2/04134 (Genomika ewolucyjna: modelowanie i przewidywanie progresji nowotworów piersi i płuc,kierownik: Prof. dr hab. inż. Marek Kimmel)

Współpraca międzynarodowa:

Wyjazdy zagraniczne:

Szkoła wiosenna, CELOD: Cellular effects of low doses and low dose rates with focus on molecular radiation carcinogenesis, Sztokholm, Szwecja, 11-22.04 2016. Instytucje organizujące: CONCERT (European Joint Programme for the Integration of Radiation Protection Research), Uniwersytet Sztokholmski
Szkoła letnia, Tenth q-bio Summer School, Fort Collins, Colorado, USA, 10-23.07.2016. Instytucje organizujące: New Mexico Consortium, Colorado State University
Staż naukowy, Rice University, Houston, USA, Opiekun: Prof. dr hab. inż. Marek Kimmel, 24.07-2.08.2016.
Staż naukowy, Rice University, Houston, USA, Opiekun: Prof. dr hab. inż. Marek Kimmel, 1.10-22.12.2019.

Współpraca:

Columbia University, Department of Systems Biology, Nowy Jork, USA – badanie ewolucji genomów SARS-CoV-2 (Prof. Simon Tavaré)
Columbia University, Department of Statistics, Nowy Jork, USA – badanie ewolucji klonalnej nowotworów (dr. Khanh Dinh)

Nagrody i wyróżnienia:

Laureatka konkursu na zwiększenie stypendium doktoranckiego z dotacji podmiotowej na dofinansowanie zadań projakościowych na stacjonarnych studiach doktoranckich w Politechnice Śląskiej w latach akademickich 2013/2014, 2014/2015, 2015/2016, 2016/2017, 2017/2018 i 2018/2019.
Laureatka konkursu na stypendium dla najlepszych doktorantów w Politechnice Śląskiej w latach akademickich 2013/2014, 2014/2015, 2015/2016 i 2016/2017.
Zwyciężczyni konkursu na najlepszą prezentację na konferencji International Conference on Man-Machine Interactions 2015. Nagroda została przyznana za prezentację pt. The resection mechanism promotes cell survival after exposure to IR.

Działalność organizacyjna:

Udział w organizowaniu międzynarodowej konferencji Gliwice Scientific Meetings w latach 2015-2018
Członek Zespołu ds. Promocji Katedry Inżynierii i Biologii Systemów w latach 2021-2022